Vers une amélioration de la détection des chaleurs dans les troupeaux bovins grâce à une nouvelle méthode de diagnostic et de conseil (DetŒstrus)

La détection des chaleurs est une étape clé de la mise à la reproduction dans les troupeaux pratiquant l'insémination animale (IA). La qualité de la détection est difficile à évaluer rendant délicat le conseil dans ce domaine. "DetŒstrus" est une nouvelle méthode de diagnostic et de conseil centrée sur la détection des chaleurs et utilisable par les conseillers dans les troupeaux bovins où l'IA est pratiquée. L'objectif de ce document est de présenter cette méthode et sa première évaluation sur le terrain. Cette méthode est innovante dans la mesure où elle permet de distinguer les problèmes liés à la vache (défaut de cyclicité post-partum, de niveau d'expression des chaleurs) de ceux liés aux pratiques de l'éleveur (défaut de sensibilité, de spécificité de la détection), et ainsi de proposer des solutions ciblées et adaptées aux contraintes et objectifs de l'éleveur. La méthode se présente sous la forme d'un document Excel® organisé en fiches qui servent de support lors de l'audit et se décline en deux versions (laitière et allaitante). La version laitière comprend une estimation de la sensibilité et de la spécificité de la détection grâce à des équations de prédiction utilisant des données facilement accessibles en exploitation et prenant en compte le niveau d'expression des chaleurs des vaches. La version allaitante comprend un simulateur permettant d'estimer la reprise de cyclicité post-partum dans le troupeau, et donc de planifier la surveillance des chaleurs pour une utilisation facilitée de l'IA. Un premier test en exploitation de la méthode montre que 89% des conseillers (40/45) et la totalité des éleveurs (24/24) ont jugé l'audit satisfaisant. 91% des éleveurs (21/23) se sentent "mieux armés" sur la détection des chaleurs après l'audit. La durée totale de l'audit (préparation et intervention) a été de 3h ± 1h en troupeaux laitiers et 2h10 ± 42min en troupeaux allaitants. Les retours de l'essai ont permis d'optimiser la méthode prochainement disponible en téléchargement gratuit sur le site de l'Institut de l'Elevage

EMA - A R package for Easy Microarray data analysis

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The increasing number of methodologies and tools currently available to analyse gene expression microarray data can be confusing for non specialist users.</p> <p>Findings</p> <p>Based on the experience of biostatisticians of Institut Curie, we propose both a clear analysis strategy and a selection of tools to investigate microarray gene expression data. The most usual and relevant existing R functions were discussed, validated and gathered in an easy-to-use R package (EMA) devoted to gene expression microarray analysis. These functions were improved for ease of use, enhanced visualisation and better interpretation of results.</p> <p>Conclusions</p> <p>Strategy and tools proposed in the EMA R package could provide a useful starting point for many microarrays users. EMA is part of Comprehensive R Archive Network and is freely available at <url>http://bioinfo.curie.fr/projects/ema/</url>.</p

Prognostic impact of vitamin B6 metabolism in lung cancer

Patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) are routinely treated with cytotoxic agents such as cisplatin. Through a genome-wide siRNA-based screen, we identified vitamin B6 metabolism as a central regulator of cisplatin responses in vitro and in vivo. By aggravating a bioenergetic catastrophe that involves the depletion of intracellular glutathione, vitamin B6 exacerbates cisplatin-mediated DNA damage, thus sensitizing a large panel of cancer cell lines to apoptosis. Moreover, vitamin B6 sensitizes cancer cells to apoptosis induction by distinct types of physical and chemical stress, including multiple chemotherapeutics. This effect requires pyridoxal kinase (PDXK), the enzyme that generates the bioactive form of vitamin B6. In line with a general role of vitamin B6 in stress responses, low PDXK expression levels were found to be associated with poor disease outcome in two independent cohorts of patients with NSCLC. These results indicate that PDXK expression levels constitute a biomarker for risk stratification among patients with NSCLC.publishedVersio

Un exemple d' exploitation des ressources en eau du karst : la production de neige à Villard-de-Lans - Corrençon-en-Vercors (Isère, France)

International audienc

Gestion de la ressource en eau pour la production de neige en stations de sports d'hiver

Poste

Gestion durable de l'eau en montagne : le cas de la production de neige en stations de sports d'hiver.

Avertissement : cette thèse traduit l'état de la question à l'été 2010. Certains faits ont pu évoluer depuis. Version corrigée au 13.03.11.Snow production is a common practice in many ski resorts (in France, two thirds of the existing sites are equipped with infrastructures intended for this purpose; and there are many projects to extend them). What appears to be a simple process - pulverizing water in cold air -, in fact reveals much about the issue of the sustainable management of water in mountainous areas. Artificial snow production is the latest use of water in these areas; it raises the question of its capacity to find a place in an integrated water management model; at stake is on one hand the conciliation of the aquatic environment's water requirements, and on the other hand all the other uses of water. In a context of global warming and its consequences on "snow resources", particularly in low-altitude mountain areas, man-made snow also raises the question of ski resorts' vulnerability, and the economic models they are based upon. Snow production therefore goes beyond the issue of just water, it is also about what governments choose to do with certain regions. Our research is based on empirical materials of various natures (interviews with those involved in snow production, field observations and documentation). We used three case studies in the French Alps: Courchevel - La Tania (Savoie), Villard-de-Lans - Corrençon-en-Vercors (Isère) and Orcières-Merlette (Hautes-Alpes). The methodology employed led us to present certain proposals, inspired by local initiatives, which make it possible to consider including snow production in a sustainable water management model in mountain areas.La production de neige est une pratique généralisée à de nombreuses stations de sports d'hiver (en France, deux tiers des sites existants sont équipés d'infrastructures destinées à cet effet ; les projets d'extension de réseaux de production de neige sont nombreux). Procédé simple en apparence – il s'agit de pulvériser de l'eau dans de l'air froid –, la pratique étudiée est vecteur de notre questionnement sur la gestion durable de l'eau en montagne. Dernière née des usages de l'eau dans ces territoires, la production de neige interroge sur sa capacité à trouver une place dans un modèle de gestion intégrée de l'eau ; l'enjeu réside ici dans la conciliation des besoins en eau pour les milieux aquatiques d'une part, et pour l'ensemble des usages de l'eau, d'autre part. Dans le cadre du réchauffement climatique en cours et de ses incidences sur la « ressource neige », en particulier en moyenne montagne, les installations de production de neige invitent également à questionner la vulnérabilité des stations de sports d'hiver ; il s'agit par là même de proposer une réflexion sur le devenir du modèle touristique qu'elles sous-tendent. La production de neige dépasse ainsi la seule problématique de l'eau ; elle est également l'expression de l'usage des territoires qu'il convient de questionner. Notre recherche s'appuie sur des matériaux empiriques de diverses natures (enquêtes auprès des acteurs impliqués, observations de terrain et documentation) et relevant de multiples échelles de travail. Parmi celles-ci figurent trois études de cas des Alpes françaises : Courchevel - La Tania (Savoie), Villard-de-Lans - Corrençon-en-Vercors (Isère) et Orcières-Merlette (Hautes-Alpes). La méthodologie employée a finalement permis de dégager un ensemble de conditions et de propositions inspirées d'initiatives locales, qui permet d'envisager l'insertion de la production de neige dans un modèle de gestion durable de l'eau en montagne

Réchauffement climatique et ressource neige en domaines skiables

International audienceSi la variabilité interannuelle des précipitations neigeuses est une réalité, la tendance à la diminution des quantités de neige en montagne est aujourd'hui un fait constaté et modélisé dans le cadre des perspectives du réchauffement climatique. La neige restant la principale ressource de l'activité des stations de sports d'hiver, les conséquences d'une diminution des quantités disponibles sur les domaines skiables ont d'ores et déjà été envisagées dans de nombreuses études. Reprenant et complétant une méthodologie existante, nous proposons ici une réflexion pour une évaluation de la fiabilité de l'enneigement naturel des stations de sports d'hiver à différents horizons temporels. Nous nous appuierons à la fois sur des données météorologiques et des informations relatives aux remontées mécaniques des stations étudiées. La méthodologie proposée est ici appliquée aux départements de Savoie et de Haute- Savoie des Alpes françaises, départements comptant de nombreuses stations de sports d'hiver (ce travail s'inscrit dans le cadre d'un monitorat en entreprise réalisé au sein de la Direction Départementale de l'Equipement et de l'Agriculture de la Savoie). Au terme de cet exercice, l'analyse critique des résultats présentés permettra de relativiser ces derniers, au regard notamment de leur part d'incertitude. Notre propos restant centré sur une analyse du risque par l'aléa, il est enfin envisagé de compléter celui-ci par des recherches sur la prise en compte de ce risque par les stations de sports d'hiver et, en ce sens, sur leur capacité d'adaptation

Un exemple d' exploitation des ressources en eau du karst : la production de neige à Villard-de-Lans - Corrençon-en-Vercors (Isère, France)

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Water and tourism in mountains : the case of artificial snow in countries of the alpine arc

PosterMountains and in particular the Alps, constitute a space where water problems have until recently been a less acute issue than elsewhere. Until now, the allocation of water resources have made it possible to support different uses and to supply downstream areas, but the increase in water requests, the expected effects of climate change and the appearance of new uses put into question the availability of the water resources in mountain areas. The aims of this research project are to analyse, the impacts of the production of artificial snow on the water resources at various spatial scales. This multiscale approach seems to be the most useful method for tackling the question of integrated water management in mountains and for integrating the logics of upstream-downstream relations. (taken into account of the piedmonts and water which leave the mountain field). The initial approach is of qualitative nature taking into account the chain of interactions and feedback between the uses and the environment. Depending on the availability of the data, the second step will be a quantitative analysis. The various impacts of the artificial snow will be evaluated according to different physical environments e.g. high and medium mountains. The study is thus focussed on the question of whether and how the use of water for the production of artificial snow can form part of a model of integrated and sustainable management of water resources, respecting as far as possible the environment and the various types of economical uses. The aim is to precisely define the conditions of installation and use of automatic snowing-making systems related to the present and future availability of water resources, environmental impacts, climate change perspectives, economic profitability, etc. In other words, the conditions under which this use is justified will be defined as well as the schedule necessary to simultaneously respect the multiple uses of water and its impacts on the natural environment. This project should enable an innovative method intended to bring help to local decision makers. The research project began in 2008 and is programmed over three years. It is financed by the Parliament of the Countries of Savoy (public corporation of interdepartmental co-operation between the French departments of Savoie and Haute-Savoie) and the French Agency of Water “Rhône Méditerranée et Corse” (public administrative corporation of the State, charged with initiating a rational use of the water resources)

Les risques associés à la production de neige en stations de sports d'hiver

Depuis la fin des années 1980, la neige de culture est largement déployée en stations de sports d'hiver pour palier les hivers sans neige. Elle nécessite des infrastructures lourdes et mobilise d'importants volumes d'eau. Dès lors, la question de nouveaux risques se pose : pour les populations situées en aval des barrages destinés à stocker l'eau pour la production de neige (retenues d'altitude) mais également pour le principe de gestion durable de la ressource en eau (conflits entre les différents usages). Il s'agira pour nous de détailler les moyens d'actions mis en oeuvre pour prévenir ces deux types de risques